МПРЗГРТ
1.Черноморец (Балчик)22193049:760
2.Добруджа 1919 (Добрич)22174155:855
3.Суворово 1 (Суворово)22123741:2039
4.Калиакра (Каварна)22113833:2436
5.Ботев (Нови пазар)221111021:3734
6.Септември 98 (Тервел)2277821:2528
7.Локомотив (Русе)2269728:2427
8.Светкавица Търговище (Търговище)2258915:2823
9.Кубрат 2007 (Кубрат)22641221:3922
10.Хитрино (Хитрино)22621418:3220
11.Доростол 2013 (Силистра)22431515:4315
12.ФК Спартак (Варна)22411721:5110
--.Интер (Добрич)82153:16-
Бележки
  - На 5 юли 2016 г. ИК на БФС утвърждава разформироването на "А" ФГ, "Б" ФГ и "В" АФГ. На тяхно място се създават Първа професионална лига, Втора професионална лига и Трета лига. За участие в Североизточна Трета лига подават заявки 9 от 12-те отбора, осигурили си място в Североизточна "В" АФГ в края на миналия сезон, както и Черноморец (Балчик), който си е осигурил място за "Б" ФГ в края на миналия сезон, но не подава заявка за Втора лига. Бенковски (Бяла, обл.Русе), Химик (Девня) и Шумен 1929 (Шумен) не подават заявки за участие в Трета лига. Заявки подават 3 отбора от ОФГ - Спартак (Варна), Хитрино (Хитрино) и Доростол 2013 (Силистра). Всички 13 подадени заявки за участие в групата са одобрени.
  - На 23 юни 2016 г. Марисан (Русе) се обединява с Русе (Русе) в Локомотив (Русе).
  - На 17 юни 2016 г. Интер (Плачидол) премества седалището си в Добрич. Отборът играе домакинските си мачове на изкуствения терен на ст."Дружба" в Добрич.
  - Светкавица Търговище (Търговище) играе домакинските си мачове на ст."Димитър Бурков" в Търговище.
  - Добруджа 1919 (Добрич) играе домакинските си мачове на ст."Дружба" в Добрич.
  - ФК Спартак (Варна) играе домакинските си мачове на ст."Локомотив" във Варна.
  - Доростол 2013 (Силистра) играе домакинските си мачове на ст."Луи Айер" в Силистра.
  - Локомотив (Русе) играе домакинските си мачове на Градски стадион и ст."Дунав" в Русе.
  - На 10 октомври 2016 г. Интер (Добрич) се отказва от участие, според клуба в знак на протест срещу несправедливо наказание на техен играч.
  - На 19 декември 2016 г. от актива на ФК Спартак (Варна) са отнети 3 точки заради неявяване без уважителна причина срещу Черноморец (Балчик).
  - На 22 февруари 2017 г. ФК Спартак (Варна) е изваден от групата заради второ неявяване без уважителни причини. Резултатите му се зачитат, а на противниците му до края на сезона се присъждат служебни победи.