МПРЗГРТ
1.Струмска слава 1927 (Радомир)22147151:1349
2.ФК Миньор (Перник)22144435:2446
3.Сливнишки герой (Сливница)22150750:1945
4.Беласица (Петрич)22128237:1944
5.Септември (Симитли)21126334:1742
6.Пирин (Гоце Делчев)22105735:2035
7.Марек 1915 (Дупница)22105728:2935
8.Хебър 1918 (Пазарджик)2294935:3131
9.Рилски спортист 2011 (Самоков)2186733:3530
10.Чавдар (Етрополе)2092937:2729
11.Пирин (Разлог)22751018:3126
12.Ботев 1937 (Ихтиман)22811334:4125
13.Балкан 1929 (Ботевград)22651133:3923
14.Велбъжд (Кюстендил)21641129:3522
15.Свобода 2011 (Пещера)22641221:4622
16.Германея (Сапарева баня)22541333:3719
17.Вихрен 1925 (Сандански)22531418:3518
18.Чепинец (Велинград)21211820:837
Бележки
  - На 5 юли 2016 г. ИК на БФС утвърждава разформироването на "А" ФГ, "Б" ФГ и "В" АФГ. На тяхно място се създават Първа професионална лига, Втора професионална лига и Трета лига. За участие в Югозападна Трета лига подават заявки 14 от 18-те отбора, осигурили си място в Югозападна "В" АФГ в края на миналия сезон; Витоша (Бистрица), Царско село 2015 (София) и Локомотив 1929 (София) са приети във Втора лига; а Септември (София) се обединява с Пирин 2002 (Разлог) във Втора лига. За попълване на освободените места в групата са поканени трите отбора, отпаднали на квалификациите за попълване през юни - Брацигово (Брацигово), Малеш 1940 (Микрево) и ОФК Костинброд 2012 (Костинброд). От тях участие заявява само Малеш 1940. В последствие са поканени и допуснати до участие и още три отбора - Балкан 1929 (Ботевград), Свобода 2011 (Пещера) и Правец (Правец).
  - Чико (Бяга) се обединява с Хебър 1918 (Пазарджик) в Хебър 1918 (Пазарджик).
  - Малеш 1940 (Микрево) се обединява с възстановен клуб от Разлог. Предстои да бъде окончателно потвърдено името на новия клуб, който е базиран в Разлог.
  - Правец (Правец) се обединява с възстановен клуб от Етрополе. Предстои да бъде окончателно потвърдено името на новия клуб, който е базиран в Етрополе.
  - Беласица (Петрич) играе домакинските си мачове в Коларово.
  - Велбъжд (Кюстендил) играе домакинските си мачове на ст."Осогово" в Кюстендил.
  - ФК Миньор (Перник) играе домакинските си мачове на ст."Миньор" в Перник.
  - Хебър 1918 (Пазарджик) играе домакинските си мачове на ст."Георги Бенковски" в Пазарджик.