Бележки
  - На 17 юли 2019 г. Чико Бунара (Бяга) се отказва от участие в Трета лига по финансови причини. ЗС на БФС - София решава групата да остане със 17 отбора.
  - Кюстендил (Кюстендил) играе домакинските си мачове на ст."Осогово" в Кюстендил.
  - На 9 март 2020 г., понеделник, с решение на БФС и с цел предотвратяване разпространението на вируса COVID-19, е спряно провеждането на всички първенства от аматьорския футбол. На 13 март 2020 г., петък, по същата причина в страната е въведено извъредно положение до 14 април, което в последствие е удължено до 13 май. С оглед на това, на 21 април 2020 г., вторник, БФС и АФЛ взимат решение да прекратят сезона в аматьорския мъжки футбол като класиранията към момента на спирането на сезона се считат за крайни. Отборите, заели 1-во място в групите от Трета лига се класират за Втора лига, с изключение на Югозападна Трета лига, където първите два отбора ще играят бараж помежду си за 1 място във Втора лига. Няма изпадащи отбори от Трета лига.
  - На 15 май 2020 г., петък, във връзка с отказването на Ботев (Гълъбово) от участие в новия сезон на Втора лига, ИК на БФС анулира предвидения бараж за 1-во място в Югозападна Трета лига и утвърждава класирането в групата към момента на прекратяването ѝ за крайно.