Бележки
  - Поморие (Поморие), 17-ти и изваден от Втора лига през изминалия сезон; не заявява участие за Югоизточна Трета лига.
  - На 14 май 2020 г. Ботев (Гълъбово), 10-ти във Втора лига през изминалия сезон; се отказва от участие. Клубът не заявява участие и в Трета лига.
  - На 14 юли 2020 г. АФК Хасково (Хасково) се обединява с Асти АБ (Хасково) в ОФК Хасково (Хасково).
  - На 21 юли 2020 г. Миньор (Раднево), 6-ти; и Свиленград 1921 (Свиленград), 8-ми през изминалия сезон; се отказват от участие. Назначен е допълнителен бараж за попълване на групата до 18 отбора.
  - Хасково (Хасково) играе домакинските си мачове на ст."Хасково" в Хасково.
  - Верея (Стара Загора) играе домакинските си мачове на ст."Трейс арена" в кв.Кольо Ганчев, Стара Загора.
  - Димитровград 1947 (Димитровград) играе домакинските си мачове на ст."Миньор" в Димитровград.
  - Марица 1921 (Пловдив) играе домакинските си мачове на ст."Марица" в Пловдив.
  - Спартак 1947 (Пловдив) играе домакинските си мачове на ст."Тодор Диев" в Пловдив.
  - Черноморец 1919 (Бургас) играе домакинските си мачове на ст."Черноморец" в Бургас.
  - Останалите отбори играят домакинските си мачове на стадионите на клубовете си.
  - През април 2019 г. Министерство на младежта и спорта създава регистър за спортните федерации и спортни клубове, развиващи дейност под тяхната егида. Вписването в този регистър е задължително условие за право на участие на всеки един клуб в официални състезания, организирани от съответната спортна федерация. За футболните клубове членове на БФС това изискване влиза в сила с началото на сезон 2020/21 г., а вписването им в регистъра започва през януари 2020 г. Към началото на сезона в групата следните участващи в нея клубове не са вписани в регистъра:
    - Извор (Горски  извор) - регистриран на 11 август 2020 г.