Бележки
  - На 14 юни 2019 г. СТК изважда Верея (Стара Загора) от Втора лига, заради решние на Лицензионната комисия от 4 юни 2019 г., което е влязло в сила от 13 юни 2019 г. Верея има право да се включи в Югоизточна Трета лига, но не подава заявка за участие в предвидения за това срок - до 13 юли 2019 г.
  - Димитровград 1947 (Димитровград) играе домакинските си мачове на ст."Миньор" в Димитровград.
  - Марица 1921 (Пловдив) играе домакинските си мачове на ст."Марица" в Пловдив.
  - Розова долина (Казанлък) играе домакинските си мачове на ст."Севтополис" в Казанлък.
  - Хасково 1957 (Хасково) играе домакинските си мачове на ст."Хасково" в Хасково.
  - Черноморец 1919 (Бургас) играе домакинските си мачове на ст."Черноморец" в Бургас.
  - На 11 септември 2019 г. от актива на Сокол (Марково) са отнети 3 точки заради неявяване без уважителна причина.
  - На 21 януари 2020 г. ФК Хасково 1957 (Хасково) се отказва от по-нататъшно участие. Резултатите му до този момент се зачитат, а на противниците му по програма до края се присъждат служебни победи с 3:0.
  - На 9 март 2020 г., понеделник, с решение на БФС и с цел предотвратяване разпространението на вируса COVID-19, е спряно провеждането на всички първенства от аматьорския футбол. На 13 март 2020 г., петък, по същата причина в страната е въведено извъредно положение до 14 април, което в последствие е удължено до 13 май. С оглед на това, на 21 април 2020 г., вторник, БФС и АФЛ взимат решение да прекратят сезона в аматьорския мъжки футбол като класиранията към момента на спирането на сезона се считат за крайни. Отборите, заели 1-во място в групите от Трета лига се класират за Втора лига, с изключение на Югозападна Трета лига, където първите два отбора ще играят бараж помежду си за 1 място във Втора лига. Няма изпадащи отбори от Трета лига.