МПРЗГРТ
1.Пирин (Благоевград)30205566:2665
2.Локомотив София 1929 (София)30195665:3062
3.Септември (София)30175854:2956
4.Лудогорец 1945 II (Разград)30148856:3850
5.Спортист 2009 (Своге)30147943:3649
6.Хебър 1918 (Пазарджик)30139850:3648
7.Литекс (Ловеч)30912936:3139
8.Созопол (Созопол)301091135:4039
9.Миньор (Перник)301091130:3739
10.Струмска слава 1927 (Радомир)308101231:3734
11.Янтра 2019 (Габрово)301041630:4734
12.Септември (Симитли)30961534:4233
13.Добруджа 1919 (Добрич)30791428:4630
14.Нефтохимик 1962 (Бургас)30761727:6127
15.Локомотив (Горна Оряховица)305101524:4325
16.Кариана (Ерден)30941729:5931
--.Витоша (Бистрица, обл.София ст.)71334:8-
--.Дунав (Русе)00000:0-
Бележки
  - На 14 май 2020 г. Ботев (Гълъбово), 10-ти през изминалия сезон; се отказва от участие.
  - На 15 май 2020 г. ИК на БФС включва Септември (Симитли) на освободеното място в групата като с това и анулира предвидения бараж за 1-во място в Югозападна Трета лига и утвърждава класирането в групата към момента на прекратяването ѝ за крайно.
  - На 12 юни 2020 г. Черноморец (Балчик), 14-ти през изминалия сезон; се отказва от участие.
  - На 25 юни 2020 г. ИК на БФС включва Спортист 2009 (Своге), 3-ти в Югозападна Трета лига на освободеното място в групата на база доклад от експертна комисия, оценила базите и стадионите на отборите кандидати за попълване на групата.
  - На 4 август 2020 г., четири дни преди началото на сезона във Втора лига и Елитна група (U-19), Дунав (Русе) отказва участие на отборите си и в двете групи, след като през същия ден е обявена и смяна на собствеността на клуба. На 5 август 2020 г. мъжкият отбор на клуба е включен в състава на Североизточна Трета лига на почиващата позиция в програмата като първия му мач е отложен. Тъй като при доброволно отказване на мъжки отбор от участие в първенството той трябва да бъде изваден в две нива по-долна група, за да е възможно участието му в Трета лига клубът и БФС постигат споразумение лицензът на Дунав за Втора лига да бъде оттеглен, което позволява включване в следващо по-долно ниво. Това решение, както и каквото и да е съобщение за оттеглянето на Дунав от Втора лига и Елитна група (U-19), обаче така и не е оповестено официално от БФС.
  - На 29 септември 2020 г. Витоша (Бистрица) уведомява БФС, че всички професионални договори на футболисти в клуба са прекратени. СТК на БФС дава срок на клуба до 16:00 ч на 30 септември 2020 г. да регистрира изискуемия минимален брой професионални футболисти. След като това не се случва, случаят е прехвърлен на Лицензионната комисия, която на 9 октомври 2020 г. отнема лиценза на Витоша за участие във Втора лига. В резултат на 13 октомври 2020 г. СТК изважда Витоша от групата. Резултатите му се анулират.
  - На 19 януари 2021 г., вторник, СТК на БФС изважда Кариана (Ерден) от групата след официално заявление за напускане на първенството от страна на клуба. Резултатите му до този момент се зачитат, а на противниците му по програма до края се присъждат служебни победи с 3:0.
  - От 8 април 2021 г. до края на сезона Янтра 2019 (Габрово) играе домакинските си мачове на ст."Ангел Кънчев" в Трявна заради ремонт на ст."Христо Ботев" в Габрово.